為實(shí)驗(yàn)選擇合適的生物緩沖液可能很棘手。這個(gè)過程就像玩“猜猜誰”。像游戲一樣,您從非常廣泛的緩沖劑列表開始,然后慢慢地提出問題和研究答案以縮小選擇范圍。到目前為止,您已經(jīng)了解了很多關(guān)于的知識(shí),并且正在尋找更多有關(guān)此小游戲的指南。在本文中,將會(huì)介紹在選擇生物緩沖劑時(shí)您應(yīng)考慮的事項(xiàng)。
步驟1:確定實(shí)驗(yàn)的pH
在許多實(shí)驗(yàn)中,您需要更改條件以使蛋白質(zhì)在溶液中保持滿意狀態(tài)。舉例來說,假設(shè)您在pH 7.4的條件下進(jìn)行了模擬生物條件的實(shí)驗(yàn),但是您的蛋白質(zhì)在此pH值下不穩(wěn)定,因此您需要優(yōu)化這種情況。要記住的一件事,目標(biāo)pH值通常離蛋白質(zhì)等電點(diǎn)(pI)大約一個(gè)pH單位(有時(shí)稍遠(yuǎn))。pI是給定的分子或蛋白質(zhì)不帶凈電荷的pH值。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)達(dá)到其pI時(shí),它的溶解度就不會(huì)那么高。
步驟2:提出正確的問題
就像游戲一樣,您必須提出正確的問題,以確保獲得正確的緩沖。在這里還是要重點(diǎn)介紹一些重要的問題:
1.溶液中是否存在可能與緩沖液絡(luò)合的金屬?
2.您的目標(biāo)蛋白是一種酶嗎?它屬于哪一類?
3.配體結(jié)合,蛋白質(zhì)穩(wěn)定性或電泳的離子強(qiáng)度要求是什么?
4.現(xiàn)有哪些文獻(xiàn)告訴我建議的緩沖劑與所用系統(tǒng)的相互作用?
所有這些問題,將進(jìn)一步幫助您找到最適合實(shí)驗(yàn)的緩沖劑。
步驟3:考慮下游實(shí)驗(yàn)
研究人員經(jīng)常遇到的一個(gè)絆腳石是,發(fā)現(xiàn)選擇的緩沖劑不適用于下游應(yīng)用。例如,已知Tris會(huì)對布拉德福德分析產(chǎn)生負(fù)面影響。其他生物緩沖液會(huì)對質(zhì)譜產(chǎn)生負(fù)面影響?;蛟S您可能已經(jīng)縮小了緩沖區(qū)的范圍,只是發(fā)現(xiàn)它在將來可能無法很好地工作。這就像“猜猜誰”的噩夢般的版本。在這種情況下,您必須進(jìn)行一些研究以找到合適的替代方法。但是,既然您已經(jīng)縮小了所需的特征,那么進(jìn)行這項(xiàng)研究就會(huì)容易一些。
步驟4:尋找合適的緩沖劑
太好了,現(xiàn)在您確切知道要使用什么緩沖劑了,到了采購環(huán)節(jié),對于大多數(shù)研究人員而言,底價(jià)和純度基本上是在購買緩沖液的重要標(biāo)準(zhǔn)。當(dāng)然,您可以去找比較有名的企業(yè),咨詢這個(gè)企業(yè)在業(yè)內(nèi)的口碑。在這里推薦一家企業(yè),不僅提供出色的緩沖劑產(chǎn)品(TRIS、HEPES、BICINE、CAPS等熱門產(chǎn)品)。而且還提供了出色的內(nèi)容和服務(wù)支持,可幫助您進(jìn)行實(shí)驗(yàn),重要的是,價(jià)格相對其他廠家更具競爭力。